Когда магический скипетр случайно переносит Эйприл в Японию XVII века, черепашки следуют за ней, чтобы спасти её. Им придётся найти утерянный скипетр, чтобы перенестись обратно в своё время, а также помочь деревушке повстанцев в их борьбе против местного феодала, князя Норинага, и злобного торговца оружием Уокера. В нашем времени в этот момент тоже совсем не скучно...По комиксам Кевина Истмана и Питера Лейрда. Черепашки вместе с девушкой Эйприл попадают в средневековую Японию, чтобы встрять в конфликт могущественного феодала с оппозицией. Одновременно равное количество японцев попадают в Нью-Йорк, где балдеют от хоккея, пива и рок-н-ролла.